南京市工商業聯合會成立于1952年5月，簡稱南京市工商聯，又稱南京市總商會。工商聯是中國共產黨領導的以非公有制企業和非公有制經濟人士為主體的，具有統戰性、經濟性、民間性有機統一基本特征的人民團體和商會組織，是黨和政府聯系非公有制經濟人士的橋梁紐帶，是政府管理和服務非公有制經濟的助手，是中國人民政治協商會議的重要組成部分。工商聯工作是中國共產黨統一戰線工作和經濟工作的重要內容，工商聯事業是中國特色社會主義事業的重要組成部分。工作對象主要包括私營企業、非公有制經濟成分控股的有限責任公司和股份有限公司、港澳投資企業等，私營企業出資人、個體工商戶、在內地投資的港澳工商界人士等。工商聯以促進非公有制經濟健康發展和非公有制經濟人士健康成長為主題履行職責，堅持政治建會、團結立會、服務興會、改革強會，充分發揮在非公有制經濟人士思想政治工作中的引導作用，在非公有制經濟人士參與政治和社會生活中的重要作用，在政府管理和服務非公有制經濟中的助手作用，在行業協會商會改革發展中的促進作用，在構建和諧勞動關系、加強和創新社會治理中的協同作用。南京市工商聯是中國工商業聯合會的地方組織。新中國成立之初，市工商聯團結南京工商界，為恢復生產、爭取國家財政經濟狀況的好轉，做了大量卓有成效的工作。改革開放以來，市工商聯圍繞經濟建設中心，服務市委、市政府工作大局，積極參政議政、建言獻策，努力探索非公有制經濟人士思想政治工作的新途徑，在強化商會職能、增強服務意識、拓展服務領域、提高服務本領等方面做了大量富有成效的工作。2010年9月16日，中共中央、國務院《關于加強和改進新形勢下工商聯工作的意見》頒布后，市工商聯在新的發展起點上迎來了可以大有作為的重要機遇期。黨的十八大以來，在以習近平同志為核心的黨中央堅強領導下，工商聯堅持圍繞中心、服務大局，牢牢把握“兩個健康”主題，貫徹團結、服務、引導、教育方針，在統籌推進“五位一體”總體布局、協調推進“四個全面”戰略布局中發揮了積極作用。截止2018年3月底，全市工商聯會員總數達到54603家，其中企業會員51022家；商會組織511家，其中行業商會217家，街鎮商會100家，異地商會91家。南京市工商聯還與全國多地工商聯建立了友好合作關系，并與全球40多個國家和地區的組織、機構、商會等建立了廣泛聯系。南京市工商聯第一、二屆主任委員為陳邃衡，第三、四、五、六屆主任委員為黃希仁，第七、八屆主任委員為徐美峰，第九屆主任委員為徐英銳，第十、十一屆會長為莊一鵬，第十二、十三、十四屆會長（主席）為祝義材。現任南京市工商聯主席、南京市總商會會長為蘇寧控股集團董事長張近東。