根據《中央編辦關于國家藥品監督管理局所屬事業單位機構編制的批復》(中央編辦復字〔2018〕115號)，中國食品藥品國際交流中心為國家藥品監督管理局所屬公益二類事業單位。其主要職責是：(一)開展食品藥品相關的國際交流與合作，開展與港、澳、臺地區食品藥品方面的交流與合作。(二)組織實施非官方的食品藥品國際交流與合作項目。(三)承擔食品藥品非官方公務來訪相關工作。(四)組織食品藥品出國(境)團組、出國(境)培訓工作。(五)舉辦食品藥品涉外會議、展覽，開展咨詢服務、培訓及技術交流。(六)開展食品藥品國際政策法規研究，承擔相關信息服務工作。(七)承擔有關境外非政府組織在中國境內登記設立代表機構等事項的技術審核工作。(八)承擔國家局機關和直屬單位出國(境)培訓、舉辦國際會議、出國(境)任務批件等前置審查工作。(九)承擔國家局機關和直屬單位因公出國(境)人員護照(通行證)、簽證(簽注)等管理服務工作。(十)承辦國家局交辦的其他事項。