南通市人民政府外事辦公室，為市政府工作部門，掛市政府港澳事務辦公室牌子。其主要職責是：一、貫徹執行黨和國家對外方針政策和法律法規，落實省市有關外事工作的指示和決定，負責政策指導、業務考核、監督檢查工作，歸口管理、統籌協調全市各領域對外交流與合作，起草外事工作相關政策規劃。二、研究分析各國發展動態和政策走向，圍繞我市經濟建設、社會發展和對外開放，為市委、市政府提供外事工作決策的建議。三、貫徹執行中央對香港、澳門的政策規定，統籌協調和歸口管理我市與香港、澳門特別行政區往來工作。四、統籌安排并承辦市委、市人大常委會、市政府、市政協領導同志的出訪和國內外事活動事項。五、接待來我市訪問的黨賓、國賓和其他重要外賓。承辦外國有關人員來訪事宜。指導全市重要外事活動的禮賓工作。會同有關部門做好涉外參觀單位的建設工作。六、承擔我市與外國有關領事機構、國際組織的業務聯系和交涉工作。審核管理在我市舉辦的國際會議。七、負責全市因公出國（境）工作的歸口管理、協調服務和監督工作。在授權范圍內，審核相關人員因公臨時出國（境）事項，承擔我市因公出國（境）人員的證照申辦業務。八、擬訂我市因公出國（境）管理規定和因公護照、通行證頒發管理實施細則。會同有關部門落實外事紀律及保密制度。九、承辦我市對外交往事務，歸口管理全市與外國友好城市、友好交流城市以及其他結好單位的交往活動。指導我市民間對外交往工作。承擔授予外國人榮譽稱號、名譽職務和給予重要獎勵等有關工作。十、指導有關部門做好來我市外國人的管理工作，依法保障來我市外國人的合法權益。負責海外僑務工作。指導、協調、管理我市社會組織對外交往事宜。會同有關部門協調處理重要涉外事件和案件，協調指導我市境外機構、公民安全與合法權益保護工作。指導全市涉外應急事務處理。十一、負責我市外事干部和涉外人員的教育培訓工作。會同有關部門進行對外宣傳和群眾性外事教育。十二、負責來我市采訪的外國記者和相關新聞機構的管理工作。十三、完成市委、市政府交辦的其他任務。