南通市科學技術協會是市委領導下的全市科學技術工作者的群眾團體，是黨和政府聯系科學技術工作者的橋梁和紐帶，是推動科學技術事業發展的重要力量。市科協機關主要職責是：（一）組織開展學術交流，活躍學術思想，繁榮學術園地，促進學科發展和知識創新。（二）根據國家有關科普工作的方針，擬定科協系統科普工作的具體計劃并組織實施。動員社會各方面力量開展科普活動和青少年科技教育活動，推廣先進技術；指導科技館等科普設施、場所的規劃、建設和管理及科普工作隊伍，舉辦科普宣傳周活動。（三）全心全意為科技工作者服務，反映科技工作者的意見和要求，維護科技工作者的合法權益。（四）組織全市科技工作者積極參政議政，參與我市科技政策的制定和政治協商、科學決策、民主監督工作，促進決策科學化、民主化。（五）表彰、宣傳優秀科技工作者，推薦人才。開展科技工作者的繼續教育和培訓工作。（六）組織開展科學論證、咨詢服務，提出政策建議，促進科學技術成果轉化，接受委托承擔項目評估、成果鑒定等任務。（七）開展民間國際科技交流與合作，發展與香港、澳門特別行政區和臺灣地區科技界及海外科技團體、科技工作者的民間交往與聯系。（八）負責對所主管的學（協、研究）會進行監督管理；對縣（市）區科協，高校（科研院所）科協、企事業科協以及農村專業技術協會工作進行業務指導。（九）組織開展反邪教工作，開展捍衛科學尊嚴和反對愚昧迷信、偽科學、反科學的活動。（十）承擔市委、市政府交辦的其它事項。