經中央機構編制委員會正式批準，1998年8月，根據國家煙草專賣局機構改革方案，正式成立中國煙草雜志社。2003年，按照中央宣傳部門的決定，《中國煙草》雜志實行“管辦分離”，明確由國家煙草專賣局主管、中國煙草雜志社主辦。中國煙草雜志社認真貫徹“堅持正確導向，服務煙草行業，探索改革思路，貼近職工生活”的辦刊宗旨，積極發揮主流媒體“喉舌、窗口、園地”的作用，為煙草行業的改革與發展服務。2013年7月，為貫徹落實中央深化文化體制改革的精神，按照非時政類報刊出版單位轉企改制工作的要求，中國煙草雜志社轉企改制后更名為《中國煙草》雜志社有限公司。目前雜志社負責《中國煙草》雜志、《新煙草》雜志、《煙草企業文化》雜志和《中國煙草年鑒》的編輯出版任務，以及“中國煙草資訊網”和移動客戶端、微信訂閱號的各項工作。《中國煙草》雜志社有限公司下設總編室、編輯一部（經濟版）、編輯二部（綜合版）、記者部、美編部、《新煙草》編輯部、網絡部、年鑒部、企業文化編輯部、中煙廣告公司 （廣告部）、發行部市場部、財務部、考評部、綜合辦公室。根據行業改革和發展的需要，《中國煙草》雜志社有限公司作為國家煙草專賣局、中國煙草總公司人事制度改革的試點單位，從2001年開始面向社會招聘員工。在20多年的發展過程中，雜志社培養和鍛煉出了經驗豐富、管理能力強、善于開拓進取的管理團隊，涌現出一批策劃能力強、采編能力強、創新能力強的優秀編輯記者。按照專業化發展、市場化運作的方向，近幾年來，《中國煙草》及《新煙草》等雜志的發行和運營情況良好，刊物的發行量逐年顯著增長。目前，《中國煙草》雜志的發行量已達6.5萬份，《新煙草》雜志的發行量已達22萬份。在繼續做大做強《中國煙草》雜志紙質刊物的同時，《中國煙草》雜志社有限公司正按照由平面媒體與網絡媒體共同發展的戰略穩步前進。