連云港市交通運輸局，為市政府工作部門。其主要職責：（一）貫徹執行國家有關交通運輸的方針政策、法律法規，組織起草交通運輸地方性行政措施草案，擬訂交通運輸行業有關政策并監督實施，指導全市交通運輸行業體制改革工作。（二）組織編制全市綜合運輸體系規劃，組織擬訂并監督實施公路、內河港口、內河航道、地方鐵路、民用航空和交通物流業等行業規劃。組織編制城市客運發展規劃，參與城市客運有關設施的規劃，指導交通運輸樞紐規劃。會同有關部門編制交通運輸固定資產投資計劃。負責交通運輸行業統計和信息發布工作。（三）組織實施國家、省、市重點和大中型交通工程建設。負責全市交通運輸基礎設施建設和維護的行業管理。負責全市內河港口岸線、陸域、水域的統一管理工作。（四）承擔全市道路、水路運輸市場監管責任。負責城市公共交通及出租汽車運輸的行業管理工作，指導交通運輸樞紐管理工作。擬訂有關交通物流業政策和標準并監督實施。（五）指導全市路政、運政、航政、港政等行政執法工作。負責全市內河通航水域的水上安全監督、內河救助打撈工作。負責船舶檢驗和船舶防污監督管理工作。（六）擬訂全市交通運輸行業投融資政策和規費政策并監督實施，提出有關財政、土地、價格等政策建議。協調并參與交通運輸建設資金籌集，負責提出交通運輸專項資金安排意見，負責交通運輸預算資金的申請、撥付和監管。指導交通運輸行業內部審計工作。（七）擬訂全市交通運輸行業科技與信息化政策、規劃和規范并組織實施，組織重大交通運輸科技項目攻關。指導協調交通運輸行業信息化項目的建設與管理。指導并監督交通運輸行業質量、技術、環保和節能減排工作。（八）負責全市交通運輸行業安全生產的監督管理。承擔并指導交通運輸行業應急處置工作。組織實施重點物資運輸和緊急運輸。（九）負責全市地方鐵路建設征地拆遷和有關協調工作。組織引導航空產業發展，依法對民用機場、航空單位實施監督管理。承辦市國防動員委員會交通戰備辦公室工作。（十）指導全市交通運輸行業隊伍建設和精神文明建設。指導交通運輸行業利用外資和國際交流合作工作。（十一）承辦市政府交辦的其他事項。