1998年12月，經市政〔1998〕38號文批準，將原桂林市住房制度改革領導小組更名為桂林市住房制度改革委員會，委員會下設辦公室（即房改辦）。2003年11月，房改機構調整，原房改機構分設為房改辦（保障中心）和住房公積金管理中心二個單位，房改辦作為桂林市住房制度改革委員會的常設機構，定為財政全額撥款事業單位。其主要職能是：貫徹落實國家、自治區房改方針、政策；負責制定全市房改方案和配套政策并組織實施；測算和擬定全市公有住房價格，對單位申報出售的公有住房進行審批；對公有住房租金標準進行測算和調整；負責全市各單位職工集資建房方案、職工住房貨幣化分配方案、公有住房上市的審核和審批；負責單位其他住房資金的管理以及使用情況的審核和審批；負責全市已售公有住房的建檔和已購公房上市的審批；負責經濟適用住房開發計劃的編制及實施；負責對市屬12縣房改辦的房改工作進行指導和監督；完成上級部門交辦的其他工作。