南京住房公積金管理中心于2003年7月成立，是直屬于南京市人民政府，不以營利為目的的獨立的正局級事業單位。中心機關設辦公室、歸集管理處、貸款管理處、資金計劃處、信息管理處、財務處、審計處、機關黨委、組織人事處、客戶服務處、稽查支隊等11個處室，下設江蘇省省級機關、南京鐵路、江寧、浦口、六合、溧水、高淳等7個住房公積金分中心，以及江蘇省監獄管理局、華東石油管理局等兩個住房公積金管理部。近年來，南京住房公積金管理中心在市委、市政府的正確領導下，緊緊圍繞“強富美高”新南京建設總體目標，以“一點一滴公積金、全心全意為人民”為宗旨，以推進制度全覆蓋為重點，以保障住房民生為主線，不斷加強歸集擴面，促進貸款惠民，規范提取使用，健全規章制度，強化風險防控，提升科技水平，推進住房公積金管理事業取得又好又快發展，在我市住房保障事業、住房消費領域和房地產市場中發揮著越來越重要的作用，為推動地方經濟社會發展作出了積極貢獻。歷經二十余年的制度發展，我市目前共有3.33萬個單位、162.16萬名職工繳存住房公積金，繳存人數達到我市社保繳存人數的70%，制度覆蓋率位居全國前列；累計歸集住房公積金1497.07億元，歸集余額632.82億元，全部用于發放貸款支持職工購房；累計發放住房公積金貸款1215.24億元，貸款余額702.92億元；中心累計發放住房公積金項目貸款3億元支持我市公租房建設，累計上繳財政增值收益約30億元用于支持我市廉租房建設。中心公積金業務管理水平、信息化服務保障能力和主要發展指標均位于全國同類城市前列。中心被南京市委、市政府評為2004—2005年度市級文明單位，被江蘇省建設廳評為全省住房公積金管理工作先進單位（2004—2007年連續4年），2005—2006年度全省建設系統精神文明建設先進單位，被江蘇省委、省政府評為2007—2009年度全省文明單位標兵。2007年度被建設部評為全國建設系統精神文明先進單位，2008年度被中央文明辦評為全國精神文明建設工作先進單位。2010年被江蘇省委、省政府評為全省文明單位標兵，2011年被中央文明辦評為全國文明單位，涌現出全國建設系統先進典型張璟同志。南京住房公積金管理主要職責：（一）編制住房公積金的歸集、使用計劃，并組織執行，編報計劃執行情況的報告；（二）編制住房公積金的年度預決算，經設區城市財政部門審核，提交管委會審議后組織執行；（三）委托由管委會按中國人民銀行規定指定的商業銀行辦理住房公積金貸款、結算等金融業務和住房公積金賬戶的設立、繳存、歸還等手續，與受委托銀行簽訂委托協議，按規定支付手續費；（四）負責住房公積金的統一核算，指導、監督分支機構的內部核算；（五）擬訂住房公積金具體管理辦法，經管委會審議通過后實施；（六）審批個人住房公積金的提取和個人住房委托貸款的發放，按照管委會審議批準的比例購買國債；（七）負責住房公積金的保值和歸還；（八）提出住房公積金增值收益分配方案，經設區城市財政部門審核，報管委會審議后執行；（九）審核單位降低住房公積金繳存比例或者緩繳的申請，報管委會批準后執行；（十）與職工、單位和受委托銀行定期對賬；（十一）建立職工住房公積金個人明細賬，向職工發放繳存住房公積金的有效憑證；（十二）組織建立管理中心及其所屬機構的業務管理信息系統，并與上級住房公積金行政監管部門聯網，納入全國住房公積金監督管理信息系統；（十三）向設區城市財政部門和管委會報送住房公積金財務報告，經管委會審議通過后定期向社會公布；（十四）向設區城市財政部門提出住房公積金呆賬核銷申請，經管委會審議通過后，根據省級財政部門的審批意見辦理呆賬核銷，并報上級住房公積金行政監管部門備案；（十五）承辦管委會決定的其他事項。