巴中市氣象局成立于1997年12月，實行四川省氣象局和巴中市人民政府雙重領導以四川省氣象局領導為主的管理體制，為正縣（處）級全民所有制事業單位，主要承擔巴中市行政區域內大氣探測、氣象通訊、天氣氣候預測、氣象服務、氣候資源開發利用、人工影響天氣、防雷減災以及氣象行政執法和行業管理等工作。巴中市氣象局成立以來，經過全市氣象工作者艱苦奮斗、扎實工作，為巴中經濟建設和社會事業發展做出了重大貢獻，多次受到各級黨委、政府和上級氣象主管部門的表彰，先后被省委、省政府評為抗旱減災工作和抗災減災工作先進單位，兩次被中國氣象局評為重大氣象服務先進集體，縣（區）氣象局均建成了市級最佳文明單位，市氣象局建成省級文明單位，全市氣象部門先后被四川省氣象局和巴中市委、市政府命名為文明氣象系統和文明行業。巴中市氣象局下轄巴州區、通江縣、南江縣和平昌縣四個縣區氣象局（站）；內設辦公室（人事教育科、監察審計室）、業務科技科（法規科）、計劃財務科三個職能科室和市氣象臺、氣象信息中心、氣象探測中心、公共氣象服務中心、財務核算中心五個直屬事業單位；管理巴中市防雷中心、巴中市人工影響天氣辦公室兩個地方氣象事業機構。全市建有國家基本氣象站和農業氣象一級站各1個、國家一般氣象站3個、區域自動觀測站217個、土壤濕度觀測站4個。全市氣象部門編制員額94人，其中，行政管理崗位29人，基本業務崗位56人，事業單位管理崗位9人。